Родившийся 8 февраля 1959 года в семье успешного предпринимателя из Лимасола, Андрей с самого детства окружалась атмосферой православной церкви.
В 14 лет он покидает дом и поступает в школу, связанную с Пафской митрополией. После завершения обучения в гимназии Пафоса 18 апреля 1976 года его рукоположил в диаконы митрополит Пафский Хризостом (Аристодиму).
Продолжив обучение на богословском факультете Университета Аристотеля в Салониках, Андрей был приятно удивлен активной церковной жизнью: "Впервые я видел молодых людей в церкви". В период учебы в Салониках он часто посещал Гору Афон.
В 1980 году, закончив университет, он приехал на Афон, вступив в братство скита Неа-Скити под руководством старца Иосифа Ватопедского. В 1982 году Андрей принял великую схиму и был рукоположен в пресвитера митрополитом Иерисским Никодимом (Анагносту).
Став духовником под руководством митрополита Верийского Павла (Янникопулоса) в 1983 году, Афанасий присоединился к усилиям братства старца Иосифа в восстановлении монашеской жизни в монастыре Ватопед. В 1987 году он стал помощником настоятеля и затем представителем обители в Святом Киноте на Афоне.
В 1991—1992 годах он занимал должность протоэпистата (управляющего) Горы Афон, став самым молодым в истории этой должности. Предложение архиепископа Кипрского Хризостома I вернуться на Кипр в 1991 году не оставило Афанасия равнодушным, и в 1992 году он перешел с тремя собратьями в монастырь святителя Николая в Пафосе.
В ноябре 1993 года братия монастыря полностью переехала в монастырь Божией Матери Махера, и 4 ноября того года отец Афанасий был избран игуменом.
С 1993 года митрополит Афанасий четырежды в месяц выступает с открытыми беседами в храмах Лимасольской митрополии и Кипрском Университете.
11 февраля 1999 года по решению Священного Синода его избрали митрополитом Лимассольским, а 14 февраля того же года произошла его архиерейская хиротония и интронизация.
В момент вступления на Лимассольскую кафедру епархия была обременена долгами, вызванными финансовыми скандалами. Для решения проблем митрополит Афанасий назначил комиссию экономистов, которая успешно избавила епархию от долгов. В стремлении к открытости перед своими прихожанами, он ввел традицию ежегодных пресс-конференций, на которых раскрываются финансовые данные, а также рассказывается о программах и начинаниях митрополии. Треть доходов Лимассольской митрополии регулярно направляется на благотворительные нужды.
Под руководством Митрополита Афанасия активно восстанавливаются действующие монастыри, а также возрождается монашеская жизнь в трех старинных обителях.
22 ноября 2005 года вместе с архимандритом Исаией (Киккотисом) он представлял Кипрскую православную церковь на церемонии интронизации Патриарха Иерусалимского Феофила III.
С 15 по 20 июля 2008 года Митрополит Афанасий сопровождал Архиепископа Хризостома II во время его визита в Москву.
Он высказывал противодействие по поводу визита папы римского Бенедикта XVI на Кипр в июне 2010 года, отмечая, что католицизм считается ересью, и Ватикан никогда не оказывал положительного влияния на проблемы Кипра. В то же время он подчеркнул, что визит папы не должен стать поводом для непристойных действий со стороны православных.
8-9 октября 2014 года Митрополит принял участие в историческом собрании игуменов и игумений Русской Православной Церкви в актовом зале Московской духовной академии.
В октябре 2020 года, вместе с митрополитом Киккским Никифором (Киккотисом), митрополитом Тамасским Исаией (Киккотисом) и хорепископом Амафунтским Николаем (Тимиадисом), Митрополит Афанасий стал одним из четырех иерархов Кипрской православной церкви, высказавших критику в адрес своего предстоятеля Хризостома II за признание автокефалии Православной церкви Украины, предоставленной патриархом Константинопольским Варфоломеем.
