Родился в семье духовных людей.
В 1848 году молодой человек в возрасте 21 года был рукоположен в священника святителем Филаретом, митрополитом Московским, и назначен клириком Успенского собора в городе Коломна. Он был известен своим строгим соблюдением церковных обрядов, активной проповеднической деятельностью и заботой о своей пастве.
Спустя восемь с половиной лет святитель Филарет перевёл его в московский храм святой Параскевы Пятницы в Охотном Ряду. Там, познакомившись с новым приходом, отец Иоанн, с разрешения святителя Филарета, начал проводить воскресные встречи со старообрядцами. Эти встречи продолжались с 1863 года и до самой его смерти, то есть почти сорок лет.
Ему было поручено занимать пост настоятеля храма святого Сергия Радонежского в Рогожской слободе, где он активно взаимодействовал со старообрядцами и проводил воскресные собеседования. Это место было известно как центр московского старообрядчества.
В 1881 году он был посвящен в протоиереи, а в 1892 году был удостоен ордена Святого Владимира 4-й степени.
В 1896 году он был приглашен стать почётным членом и помощником председателя московского миссионерского Братства святого Петра Митрополита. Он активно участвовал в работе братства с момента его основания в 1872 году.
В 1898 году митрополит Московский Владимир, отмечая свой пятидесятилетний юбилей священства, совершил Божественную Литургию в храме преподобного Сергия в Рогожской слободе. Он лично поздравил отца Иоанна, настоятеля храма, и высоко оценил его вклад в борьбу против раскола.
Более пятидесяти лет отец Иоанн с неустанной ревностью исполнял свою пастырскую и миссионерскую миссию, становясь великим и незаменимым борцом против раскола. Он неустанно трудился делом, словом и писанием на пользу Православной Церкви. Для многих его духовных детей он был добрым пастырем, опытным руководителем, наставником и мудрым советником.
Весной 1901 года отец Иоанн заболел и отправился к своим родственникам на дачу, недалеко от Спасо-Влахернского монастыря в Московской губернии, надеясь на выздоровление. Однако он не смог побороть болезнь и скончался 14 июля 1901 года, после того как принял последние таинства и причастие. Отец Иоанн был похоронен рядом с монастырским храмом на территории Спасо-Влахернского монастыря.
Дочь пастора, который ушел из жизни, нашла его духовное завещание, в котором он просил похоронить его на Семёновском кладбище. Следуя его желаниям, дочь получила разрешение на перенесение тела своего отца на это кладбище. 16 сентября 1906 года, с разрешения церковной и гражданской власти, тело было перенесено из Спасо-Влахернского монастыря на Московское Семеновское кладбище. По благословению Московского митрополита Владимира, тело заслуженного протоиерея было захоронено в храме Воскресения Христова на Семёновском кладбище, рядом с северной стеной.
